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院系实验室是高等院校实验室体系的主要组成部分。长期以来，由于受到管理体制与自身体系建设的影响，院系实验室资源没有得到充分利用。文章论述了院系实验室应当建立内外开放式的运行机制和全过程协同的运行机制，从按学科调整、跨院系协作、区域内共享这三个方面入手，不断增强院系实验室资源的教学服务功能、科研服务功能和社会服务功能，实现院系实验室资源的优化利用。