【摘 要】
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目的探讨电离辐射影响人成纤维细胞基因表达的转录调控机制,并构建基因与相应转录因子的调控网络。方法先对前期研究已经获得的差异表达基因进行功能注释,选择结合功能类基因(数
【机 构】
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南方医科大学基因工程研究所,福建医科大学生物化学与分子生物学系,华南基因组研究中心
【基金项目】
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广东省生物芯片重点实验室基金(No.2004B60144).
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目的探讨电离辐射影响人成纤维细胞基因表达的转录调控机制,并构建基因与相应转录因子的调控网络。方法先对前期研究已经获得的差异表达基因进行功能注释,选择结合功能类基因(数量最多)进入研究;再用MaxLAPS,TFME和SCOPE3种软件预测这些基因的转录因子和转录因子结合位点;利用Bibliosphere软件构建转录因子与基因的转录调控网络。结果获得25条Gene Symbols,基因本体功能注释集中于结合功能(共19条),2种程序预测得到14个相同的转录因子,得分最高的6个转录因子结合位点对应的转录因子与预
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