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H-Y抗原是组织相容性抗原中次要的一个,与异型配子有关,参与性腺分化。最初认为H-Y抗原的编码基因位于Y染色体上,但在某些核型XX的男性伴睾丸发育不良或有一个睾丸及一个卵巢的两性畸形中可测出H-Y抗原。Ohno提出Y染色体易位于常染色体假说,但断裂的片段总未能检出。目前推测:H-Y抗原的结构基因位于常染色体