草鱼呼肠孤病毒HZ08株S4基因序列分析

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【摘要】

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草鱼呼肠孤病毒HZ08株是本实验室从患出血病草鱼体内分离到的一个新毒株,已完成部分基因序列的分析,其氨基酸序列的同源性和873株相比,仅为20%～30%之间。因序列差异较大,无法

【作者】

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曾伟伟王庆张超张乐生刘宝芹刘永奎石存斌吴淑勤

【机构】

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中国水产科学研究院珠江水产研究所,上海海洋大学水产与生命学院

【出处】

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生物学杂志

【发表日期】

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2012年2期

【关键词】

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草鱼呼肠孤病毒 S4基因序列分析遗传进化树 grass carp reovirus segment 4 sequencing phylogene

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草鱼呼肠孤病毒HZ08株是本实验室从患出血病草鱼体内分离到的一个新毒株,已完成部分基因序列的分析,其氨基酸序列的同源性和873株相比,仅为20%～30%之间。因序列差异较大,无法通过设计特异性引物来扩增和分析其基因序列,采用单引物扩增技术,对HZ08株S4基因进行序列分析表明：S4全长为2263 bp,最大的ORF编码717个氨基酸,推导出其表达的蛋白约为79 kDa。正如其他基因节段,基因末端也含有保守碱基序列5＇（GUAAUUU…UUCAUC）,3＇。S4基因推导的氨基酸序列与同宿主的其他呼肠孤病毒的

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