【摘 要】
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将代码为1gca蛋白质的氨基酸序列映射为疏水值序列,在合适的尺度下,通过连续小波变换法分别对其a螺旋,a螺旋和β折叠之间的连接多肽(即部分规则和无规则二级结构)进行预测,准
【机 构】
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中山大学化学与化学工程学院,中山大学化学与化学工程学院
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将代码为1gca蛋白质的氨基酸序列映射为疏水值序列,在合适的尺度下,通过连续小波变换法分别对其a螺旋,a螺旋和β折叠之间的连接多肽(即部分规则和无规则二级结构)进行预测,准确率分别为76.5%和85.7%.从PDBsum数据库中随机抽取100个蛋白质作为测试对象,其中全a螺旋、全β折叠、α/β以及α+β蛋白质各25个.在100个蛋白质中共有1618个连接多肽和747个a螺旋.本法预测到的连接多肽共有1536个,其中1308个与实际结构一致,平均预测准确率为85.2%;预测到的a螺旋有770个,其中581个
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