青蛤(Cyclina sinensis)IKK基因的克隆及其在鳗弧菌(Vibrio anguillarum)刺激下的表达分析

来源 :海洋与湖沼 | 被引量 : 0次 | 上传用户：zxms008

【摘要】

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利用构建的青蛤(Cyclina sinensis)转录组文库,筛选到青蛤IKK 基因的类似序列。经设计引物克隆比对后确认为CsIKK 基因。利用生物信息学软件在线对该基因进行结构分析。采用P

【作者】

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侯梓园高姗潘宝平闫春财

【机构】

：

天津师范大学生命科学学院天津市动植物抗性重点实验室,天津市兴南中学

【出处】

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海洋与湖沼

【发表日期】

：

2019年2期

【关键词】

：

青蛤 CsIKK基因鳗弧菌荧光定量PCR

【基金项目】

：

天津市自然科学基金项目,18JCYBJC96100号;天津市科学技术普及项目,17KPXMSF00040号;天津市高校“中青年骨干创新人才培养计划”,135305JF79号;天津师范大学基金项目,043135202-XK1706号,043135202-XB1715号;天津师范大学引进人才基金项目,5RL104号;天津市高等学校科技发展基金项目,20090608号

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利用构建的青蛤(Cyclina sinensis)转录组文库,筛选到青蛤IKK 基因的类似序列。经设计引物克隆比对后确认为CsIKK 基因。利用生物信息学软件在线对该基因进行结构分析。采用PCR 技术克隆基因,并使用实时荧光定量PCR 技术克隆得到CsIKK 基因在青蛤五个不同组织中的表达情况及在鳗弧菌(Vibrio anguillarum)的刺激下IKK 基因在青蛤血淋巴中的时序性表达情况。综合结果得到, CsIKK 基因序列开放阅读框长2298bp,编码765 个氨基酸。IKK 基因在青蛤的血淋巴、外

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