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目的
分析HCV核心蛋白(Core)和非结构蛋白(NS)5B区直接测序的敏感性和准确性。
方法收集慢性丙型肝炎患者血清51份,采用反转录PCR对Core和NS5B区分别扩增,产物直接测序,构建进化树进行基因分型。
结果51份样本中,Core区扩增阳性49份,占96.1%。共检出5种基因亚型:1b为61.2%(30/49),2a为20.4%(10/49),2b为2.0%(1/49),3a为4.1%(2/49),6a为12.2%(6/49)。NS5B区扩增阳性45份,占88.2%。1b、2a、2b、3a、6a分别占62.2%(28/45)、20.0%(9/45)、2.2%(1/45)、4.4%(2/45)和11.1%(5/45)。
结论与NS5B区相比,Core区引物设计容易,扩增效率和分型成功率较高,可作为HCV基因型流行病学调查和临床研究的优先选择。