【摘 要】
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目的:运用单核苷酸多态性芯片检测口腔白斑(OLK)及鳞癌(OSCC)的DNA变化。方法:利用SNP6.0Ar-ray基因芯片对906,660个SNP(单核苷酸多态性)位点进行分型检测,对946,000位点进行
【机 构】
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南京市口腔医院·南京大学口腔医学院,
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目的:运用单核苷酸多态性芯片检测口腔白斑(OLK)及鳞癌(OSCC)的DNA变化。方法:利用SNP6.0Ar-ray基因芯片对906,660个SNP(单核苷酸多态性)位点进行分型检测,对946,000位点进行拷贝数变异检测,DNA序列分析验证。结果:OLK和OSCC中存在复杂的遗传变异,主要位于染色体3、5、7、8、9、11、13、14、15、17、18上。结论:微阵列比较基因组杂交是研究OLK发病机制的新方法,多个基因参与OLK癌变的发生发展。
Objective: To detect DNA changes in oral leukoplakia (OLK) and squamous cell carcinoma (OSCC) by single nucleotide polymorphisms (SNPs). Methods: The genotypes of 906,660 SNPs were genotyped by SNP6.0Ar-ray microarray. The 946,000 loci were tested for copy number variation and DNA sequence analysis. Results: There were complex genetic variations in OLK and OSCC, mainly on chromosomes 3, 5, 7, 8, 9, 11, 13, 14, 15, 17 and 18. Conclusion: Microarray comparative genomic hybridization is a new method to study the pathogenesis of OLK. Multiple genes involved in the occurrence and development of OLK carcinogenesis.
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