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对6种(株)昆虫微孢子虫和1种鱼微孢子虫的孢子表面蛋白进行了电泳分析。孢子表面蛋白的SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳图谱测定,可重复性高,并具有种的特异性。通过计算多肽带的相对迁移率,用欧氏距离法计算每种之间的相似系数,用算术平均的不加权对群法进行聚类,得出一种表示种间距离的表型图。两侏家蚕微孢子虫的相似系数是0.98,表明它们是同一种;两种玉米螟微孢子虫的相似系数是0.9,作者认为它们是同种。柞蚕微孢