【摘 要】
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为了解H5N2亚型禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)的血凝素蛋白(Hemag-glutinin,HA)系统进化特征,借助NCBI influenza virus resource数据库,下载禽源A型流感病毒(Influ
【机 构】
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西南林业大学生命科学学院,云南昆明650224;云南省动物疾病预防控制中心,云南昆明650034;会泽黑颈鹤国家级自然保护区管护局,云南曲靖654200;云南省热带亚热带动物病毒病重点实验室,云南昆明
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为了解H5N2亚型禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)的血凝素蛋白(Hemag-glutinin,HA)系统进化特征,借助NCBI influenza virus resource数据库,下载禽源A型流感病毒(Influenza A Virus,IAV)H5N2亚型HA核酸序列,分析毒株的宿主、分离时间等特征,并构建HA蛋白的遗传进化树,分析其系统发生.结果显示:NCBI数据库收录的H5N2 AIV的HA核酸序列1 272条,序列在NCBI发布时间集中于2005-2007年、2011年、2014-2016年;582条序列为野禽来源,宿主主要分布于雁形目、鸡形目和鹆形目的野禽.系统发生分析结果表明:H5N2 AIV的HA蛋白可聚类为亚欧谱系及北美谱系两大分支,前者可分为三个亚系,后者可分为两个亚系.研究结果呈现了H5N2 AIV HA基因在时间及空间上的进化特征,为H5N2 AIV引起的疫病预警和防控提供理论基础.
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