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沙田柚性状优良却多核，通过多倍体选育获得无核或少核品种具有很高的价值。本研究运用AFLP技术分析沙田柚多倍体基因组的变化，以期为多倍化选育优良品种提供一定的理论依据。结果表明，多倍体沙田柚基因组存在大量片段的丢失，也有许多新的酶切位点出现，变异率在21％-29％之问。其中多个位点同时发生了相同变异，暗示着多倍体基因组的进化并不是一个随机事件，而这些变异与哪些表观遗传变异直接相关，还有待深入研究。