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目的
运用甲基化DNA免疫共沉淀联合高通量测序（methylated DNA immunoprecipitation coupled with next-generation sequencing，MeDIP-seq）技术初步构建伴迟发性运动障碍（tardive dyskinesia，TD）精神分裂症患者的基因甲基化谱。
方法入组伴TD精神分裂症患者5例（TD组）、不伴TD精神分裂症患者5例（非TD组）及健康志愿者5名（对照组），提取外周血全基因组DNA，制备MeDIP-seq文库。采用Agilent 2100生物分析仪质控评估MeDIP-seq文库后使用Illumina HiSeq 2000测序平台进行高通量测序。依次使用Off-Line Basecaller V1.8、BOWTIE V2.1.0及MACS V2对测序结果进行分析处理，再通过MACS V2识别每个样本的全部MeDIP峰，统计阈值设为富集倍数>2，同时q<10-5。人口学及临床资料统计检验水准为α<0.05。
结果3组年龄（F=0.13）、受教育年限（F=0.23）、性别（χ2=10-13）差异均无统计学意义（均P>0.05）；TD组与非TD组病程（t=-0.39）、用药时长（t=-0.68）差异均无统计学意义（均P>0.05）。TD组、非TD组和对照组启动子区MeDIP峰相关基因数分别为1 731、1 673和1 728个，TD组与对照组差异基因数为161个，与非TD组的差异基因数为372个，其中161个为TD组与非TD组及对照组的共同差异基因数。
结论本研究初步构建了伴TD精神分裂症患者的基因甲基化谱，为后续研究限定目标基因范围提供了一定依据，但DNA甲基化在TD发生中的具体作用还需要进一步研究。