【摘 要】
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本文拟通过对2株从酱油渣中分离获得的蜡样芽孢杆菌用DNA纯化试剂盒提取全基因组DNA,并用胶回收试剂盒纯化后,构建质量合格的测序文库并进行Solexa基因组重测序,获得基因组序
【机 构】
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华南理工大学轻工与食品学院,美国马里兰大学微生物病理系
【基金项目】
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国家973计划项目(2012CB720800);国家自然科学基金青年基金项目(31201362);中央高校基本科研业务费面上项目(2012ZMO060)
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本文拟通过对2株从酱油渣中分离获得的蜡样芽孢杆菌用DNA纯化试剂盒提取全基因组DNA,并用胶回收试剂盒纯化后,构建质量合格的测序文库并进行Solexa基因组重测序,获得基因组序列后对其测序质量进行评估,并对基因组信息进行分析,其中包括利用mapping分析研究2株菌相对于参考基因组的各自的变异基因,并找到其共有变异基因,并对共有变异基因进行COG注释、GO功能注释及KEGG生物学通路分析,通过对变异基因的这些分析,结合文献中其他对蜡样芽孢杆菌耐盐的研究,在基因功能分析的基础上找出决定其耐盐能力的关键基因,
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