嗜酸氧化亚铁硫杆菌基因组分泌蛋白的初步分析

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利用信号肽预测软件SignalPv3.0、跨膜螺旋结构预测软件TMHMMv2.0和非经典分泌蛋白预测软件SecretomeP对嗜酸氧化亚铁硫杆菌全基因组的3218个氨基酸序列进行预测分析。结果表明在嗜酸氧化亚铁硫杆菌中有507个蛋白为分泌蛋白,其中分泌型信号肽120个(其中有9个为RR-motif亚组型信号肽),脂蛋白信号肽3个,Prepilin—like信号肽4个,非经典分泌蛋白380个。并对分泌型信号肽的长度分布、氨基酸使用频率和酶切位点的氨基酸使用频率作了统计。得分最高的100个非经典分泌蛋白中,有
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