【摘 要】
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目的:初步探讨长链非编码RNA(lnc RNA)在研究头颈鳞癌(HNSCC)放疗中的作用。方法:将HNSCC-SCCⅦ细胞分为对照组(不予放疗)和实验组(予放疗干预),应用芯片技术,筛选出放疗干预
【机 构】
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贵州医科大学附属白云医院耳鼻咽喉科,贵州医科大学附院耳鼻咽喉科,贵州省人民医院耳鼻咽喉科
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目的:初步探讨长链非编码RNA(lnc RNA)在研究头颈鳞癌(HNSCC)放疗中的作用。方法:将HNSCC-SCCⅦ细胞分为对照组(不予放疗)和实验组(予放疗干预),应用芯片技术,筛选出放疗干预后HNSCCSCCⅦ细胞中差异表达的lnc RNA及m RNA,通过Cis和Trans法对靶基因进行预测,应用DAVID软件进行KEGG通路筛选,得到对应的靶基因富集的KEGG通路包括肿瘤相关通路、Wnt信号通路及轴突导向通路,分析这3条通路上对应的靶基因,并找到与这些靶基因对应的lnc RNA。结果:筛选出1 280条放疗差异表达的lnc RNA,对照组相对实验组高表达5倍以上的共15条,低表达5倍以上的共8条;筛选发现表达差异的m RNA有1 087条,对照组相对实验组高表达的528条,对照组相对实验组低表达559条;KEGG通路信息分析lnc RNA对应的靶基因富集于肿瘤相关通路、Wnt信号通路和轴突导向通路;Wnt信号通路中靶基因PRKCA和STAT5B对应的lnc RNA与m RNA是共表达的,对应的16203-3lnc RNA在对照组的表达为实验组的3.176倍(P<0.05),对应的31238-3lnc RNA在实验组中的表达量为对照组中的2.037倍(P<0.05)。结论:PRKCA和STAT5B可能是控制HNSCC放疗反应敏感性的靶基因,对应的16203-3lnc RNA和31238-3lnc RNA可作为调控HNSCC放疗敏感性的候选lnc RNA。
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