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利用分子克隆技术成功获得麦洼牦牛HOXA6 基因编码区序列，并结合内参基因通过实时相对定量PCR法检测HOXA6 基因在麦洼牦牛各组织中的表达分布。采用生物信息学方法对该基因及其编码的蛋白进行基本理化性质、疏水性、二级结构等分析，并构建原核重组表达系统。结果表明，该基因包含一个大小为702 bp的开放阅读框，编码233个氨基酸；所编码的蛋白属于亲水性蛋白，二级结构主要由无规则卷曲和α螺旋为主。HOXA6 基因的编码产物氨基酸进化树表明，HOXA6 基因进化极其保守，牦牛HOXA6 与牛、绵羊、马等物种氨基