[目的]对云南省迪庆藏族自治州2012-2013年两家医院分离的金黄色葡萄球菌(MRSA)菌株进行了分子流行病学分析,以此了解该地区MRSA耐药情况。[方法]采用脉冲场凝胶电泳(Pulsed-Feld Gel Electrophoresis,PFGE)、多位点测序分析(multilocus sequence typing,MLST),药物敏感试验和毒力基因检测等方法对19株MRSA进行分析研究。[结果]所有菌株对β-内酰胺类抗生素耐药,部分菌株对喹诺酮类、大环内酯类、四环素以及磺胺类药物耐药;毒力基因检测结果表明,所有菌株均携带有溶血素基因以及不同组合的肠毒素基因;PFGE结果显示19个菌株共产生11个PFGE带型,具有非常高的分辨率水平;MLST分型结果显示,19株MRSA共产生3个ST型别,其中以ST59和ST121型菌株为主。[结论]云南省迪庆藏族自治州MRSA菌株耐药水平不容忽视,菌株的毒力基因携带情况增加了病原菌的致病能力;MRSA的流行株在迪庆藏族自治州地区均有不同程度的分布,同时PFGE对MRSA的分型水平高于MLST,同时又与MLST分型方法具有良好的相关性。