基于支持向量机识别真核生物DNA中的翻译起始位点

来源 :生物物理学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：yxhly

【摘要】

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翻译起始位点(TIS)的识别是真核生物基因预测的关键步骤之一,近年来一直得到研究人员的高度重视.基于TIS附近序列的统计特性,出现了一些辨识TIS的判别方法,但识别精度还有待

【作者】

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詹泳周艳红卢正鼎

【机构】

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华中科技大学计算机学院

【出处】

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生物物理学报

【发表日期】

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2003年4期

【关键词】

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支持向量机翻译起始位点数据优化敏感度 DNA Support vector machine Translation initiation site D

【基金项目】

：

国家自然科学基金，湖北省自然科学基金，华中科技大学校科研和教改项目

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翻译起始位点(TIS)的识别是真核生物基因预测的关键步骤之一,近年来一直得到研究人员的高度重视.基于TIS附近序列的统计特性,出现了一些辨识TIS的判别方法,但识别精度还有待进一步提高.针对传统支持向量机(SVM)方法中存在的不足,提出了基于数据优化法的SVM,它通过其它统计学模型优化训练数据集,进而提高分类器的辨识精度.实验结果表明基于数据优化法的SVM分类器在翻译起始位点的辨识上可获得比其他判别方法更好的效果.

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