宁都黄鸡粪便基因组DNA提取方法比较及盲肠微生物组成分析

来源 :家畜生态学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ltsomeday
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要获得高质量的测序结果,一个重要的前提是提供高质量的DNA样品。该研究旨在比较4种样本预处理方法和目前国内通用的3种试剂盒对于盲肠内容物基因组DNA提取的质量,并通过扩增子测序结果分析宁都黄鸡盲肠菌群组成及其多样性,为进一步探索肠道微生物在宁都黄鸡生长中的作用,乃至未来禽微生态制剂的研发奠定基础。结果表明:QIAGEN、BioTeke或BIOMIGA公司试剂盒提取的基因组DNA用于扩增子测序,所得肠道微生物菌群Beta多样性分析结果无显著差异(P>0.05),而Shannon指数和Simpson指数
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催化剂中添加H2O2可克服凯氏定氮法消化时间过长的弊端。为研究此改良方法的稳定性和具体消煮时间,该试验通过调整催化剂中H2O2添加量和消化时间,测定和比较不同原料改良方法和凯氏定氮法测定值的比值。结果表明:(1)用H2O2完全取代混合催化剂,不同原料两种测定值的比值差异显著(P<0.05或0.01),且消化不完全;(2)用样品量1.5倍的H2O