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目的：研究生育保险病种费用影响因素,为生育保险按病种付费提供依据。方法：抽取南京市4家医院2002～2004年生育保险参保人员病历首页以及财务结算帐单1525份,用结构方程模型（SEM）方法分析。结果：临床特征、医护质量和社会经济特征三个隐变量对住院费用的影响系数分别为0.9334、0.3194、0.2230,病种临床特征对住院费用影响最大。结论：SEM分析生育保险病种住院费用影响因素收到很好的效果。