【摘 要】
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[目的]研究四路糯与普通玉米之间的亲缘关系。[方法]比较四路糯与B73基因组中“124”转座子的构成差异。[结果]在B73基因组中鉴定出13个“124”转座子序列和其插入位点信息;通过重测序得到约120 Gb的四路糯基因组序列,并从中鉴定出17个“124”转座子序列和其插入位点信息;在二者基因组中存在3个共同的“124”插入位点,这些位点展示出“124”转座子在序列和插入位点一致;B73基因组和四
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(32060459); 云南省博士后定向培养资助(云人社通[2018]168号); 科技部财政部国家科技资源共享服务平台项目国家作物种质资源库课题“云南作物资源收集保存与共享利用”(NCGRC-2020-030); 生物资源数字化开发应用(202002AA10000
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[目的]研究四路糯与普通玉米之间的亲缘关系。[方法]比较四路糯与B73基因组中“124”转座子的构成差异。[结果]在B73基因组中鉴定出13个“124”转座子序列和其插入位点信息;通过重测序得到约120 Gb的四路糯基因组序列,并从中鉴定出17个“124”转座子序列和其插入位点信息;在二者基因组中存在3个共同的“124”插入位点,这些位点展示出“124”转座子在序列和插入位点一致;B73基因组和四路糯基因组中均存在与waxy基因中“124”一致的转座子序列;建立的系统进化树可将“124”转座子归为4种类型,其中并没有单一基因组来源的类型。[结论]四路糯与B73基因组的差异是玉米种内的差异。
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