纪检监察与检察机关查办案件协作问题，应当在建立健全联席会议制度、规范移送审查机制、健全查办案件协作制度、建立预防职务犯罪联系网络上进行研究，自觉运用法治思维和法治方式，建立合法依规的协作机制，才能解决协调与配合过程中引发的各种问题。进一步加强办案工作中的协调与配合。纪检监察和检察机关在受理初查、调查案件的过程中，要根据查办案件的具体情况适时通报案情，充分借力各自的工作优势，通过协调配合机制推动办案工作。纪检监察机关在案件突破之时，应及时通知检察机关启动侦查程序，同步介入案件的初查、侦查调查，同步固定证据，通过法定的侦查手段，整合办案力量，提高工作效率，迅速把办案工作推向深入。检察机关在初查案件中需要接触被初查对象时，可根据办案需要及时通报纪检监察机关，以便于纪检监察机关及时介入调查，也便于适时借力纪检监察机关的“双规”、“双指”等手段，为突破案件创造更好的时机。