大豆棉子糖合成酶基因生物信息学及表达分析

来源 :基因组学与应用生物学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:codeandme
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棉子糖是一种广泛存在于植物中并参与植物抵抗各种非生物逆境胁迫的重要碳水化合物.棉子糖合成酶(RS)是催化肌醇半乳糖苷和蔗糖产生棉子糖的关键酶.本研究对大豆中3个编码RS的基因序列进行生物信息学分析.结果 显示,3个RS基因所编码的蛋白序列长度从758到782个氨基酸残基,等电点分别为6.07、6.39和6.07.RS蛋白主要定位于叶绿体或/和细胞核中,且均含有不同数量的丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)和酪氨酸(Tyr)磷酸化位点.蛋白系统进化分析表明,GmRS1、GmRS2与豌豆PsRS的亲缘关系最近,GmRS3与拟南芥AtRS5和黄瓜CsRS的亲缘关系最近.启动子序列分析表明,3个RS基因启动子序列中含有多种逆境相关顺式作用元件.实时荧光定量PCR结果显示,GmRS1和GmRS3在高盐、干旱、低温和高温处理下表达量上升,而GmRS2仅在高温处理下表达量上升.表明大豆3个RS基因均可不同程度响应非生物胁迫.
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