辣椒WOX基因家族的鉴定及分析

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利用辣椒的全基因组数据,通过生物信息学方法,从辣椒中鉴定出了10个WOX基因,并按照其在染色体上的分布顺序命名为CaWOX1,CaWOX2,…,CaWOX10,并对其理化性质、染色体定位、与番茄的进化关系、蛋白保守基序、组织表达水平及高、低温处理下的表达量进行分析。结果表明:该家族各成员的理化性质差异较大,且只分布在0、2、4、6、11五条染色体上;系统进化树分析表明,辣椒WOX基因家族可分为现代、中间、古代3支,与番茄进化发育关系一致;蛋白保守基序预测分析结果显示,除CaWOX3外,其余基因都含有Motif1与Motif2,且二者总是紧密相连出现;组织表达水平分析结果表明,CaWOX4等基因具有特异性表达模式;高温、低温处理能够刺激或抑制WOX基因家族成员的表达。
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