基因组“k字”频数普适关系的研究

来源 :内蒙古大学学报：自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：zongbangsheng

【摘要】

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寻找物种基因组中k-mer频数分布的特征，对几个典型物种的基因组序列进行了统计分析．区分“字”域和“频数”域。运用两种求信息熵的方法——Shannon信息熵和Fisher信息熵，定义了

【作者】

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李培芳贾晓超李宏罗辽复

【机构】

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内蒙古大学理工学院物理系

【出处】

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内蒙古大学学报：自然科学版

【发表日期】

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2006年2期

【关键词】

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基因组 k-mer 频数信息熵 genome k-mer frequency information-entropy

【基金项目】

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国家自然基金项目（90103030）

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寻找物种基因组中k-mer频数分布的特征，对几个典型物种的基因组序列进行了统计分析．区分“字”域和“频数”域。运用两种求信息熵的方法——Shannon信息熵和Fisher信息熵，定义了五种k-mer频数的泛函．发现对于每一物种，由Shannon信息熵定义的四种泛函与k之间都具有很好的线性关系，并且这种线性关系在所研究的物种问具有普适性．

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