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目的
探讨低分子量蛋白酶体(low molecular weight polypeptide, LMP)基因多态性与丙型肝炎病毒(hepatitis C virus , HCV)慢性感染的相关性。
方法选择云南地区汉族人群HCV慢性感染患者427例,健康对照者412名,采用TaqMan探针基因分型方法对LMP2基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)rs1351383、rs17587、rs2127675和LMP7基因SNPrs2071543进行基因分型,并构建单倍型,统计LMP2和LMP7多态性位点的等位基因频率与基因型频率、单倍型频率,分析SNPs及单倍型与HCV慢性感染的相关性。
结果病例组和对照组LMP2基因rs1351383和rs2127675的等位基因频率差异有统计学意义(P<0.05),rs1351383/rs17587/rs2127675单倍型A-G-A和C-G-G差异有统计学意义(P<0.05);其他位点基因型、等位基因型、单倍型频率在病例组和对照组中差异无统计学意义(P>0.05)。
结论在云南汉族群体中, LMP2基因SNP rs1351383 C等位基因和rs2127675 G等位基因可能是HCV慢性感染的易感因素,rs1351383/rs17587/rs2127675单倍型A-G-A可能是HCV慢性感染的保护因素,单倍型C-G-G可能是HCV慢性感染的危险因素。