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通过16例人肺鳞癌和小细胞肺癌组织中表达蛋白的二维电泳分离和质谱分析, 经数据库检索鉴定了53个蛋白, 其中24个蛋白与肺癌发病机制相关, 4个蛋白在其它癌症中有报道. 表达呈现差异的蛋白点有44个, 其中34个在表达量上有差异, 10个蛋白在鳞癌和小细胞癌间表现为有和无的关系. 蛋白功能分析提示人肺鳞癌与小细胞癌的蛋白质组表达存在差异, 分析这些差异蛋白有利于肺癌分型及其生物标志物研究.