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2000～2001年台湾海峡南部海域游泳生物调查研究结果表明,该海域的游泳生物有365种,其中鱼类272种(硬骨鱼类261种,软骨鱼类11种),隶属20目,86科179属;其次为甲壳类70种;头足类23种.暖水性鱼类种类208种,占鱼类种数的76.47%;暖温性鱼类为64种,占23.53%;无冷温性鱼类.鱼类区系属于印度-太平洋的中国-日本亚区.种类数的季节变化依次呈秋季大于春季大于冬季大于夏季.生物量的季节变化,依次呈夏季大于秋季大于冬季大于春季.而生物量尾数的季节变化依次呈春季大于冬季大于秋季大于夏季