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国内大量新城疫病毒（NDV）血凝素基因F和HN的测序表明，NDV主要免疫原HN和F基因与生产中广泛应用的经典疫苗LaSota株的核苷酸同源性不足80％，而NDV流行株之间则高达94．4％-100％，从分子遗传学角度证实了VIId型NDV是导致新城疫免疫失败的重要原因。HI交叉抑制和鸡胚中和试验等则从抗原性的角度证实了NDV在免疫压力下抗原性的变化，尽管NDV不同毒株间抗原性变异的程度已出现明显差异，但仍局限在同一个血清型中。