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电力系统发展对电网在线安全计算提出新的要求。提出一种适用于大电网系统状态估计的嵌套对角加边（bordered block diagonal form，BBDF）雅可比矩阵分割算法。该算法基于大电网地理区域信息，利用边割集自外而内形成电网的嵌套对角加边的结构，将状态估计在解耦后的各分区内实现。针对该算法，还提出一种分布式数据存储方式，不但能满足一般电网的状态估计计算要求，而且特别适用于当电网拓扑信息发生改变时的状况。通过算例验证了算法的有效性。