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高台沟硼矿位于吉南集安地区，含硼岩系普遍经受中一高级区域变质作用，区域上含矿镁质岩石类型划分为镁橄榄岩大理岩混合型和大理岩型两种矿化类型，高台沟硼矿属于镁橄榄岩大理岩混合型硼矿。含矿层岩石为灰绿色和黄绿色蛇纹岩，顶部岩石为金云母、透辉、滑石岩或金云透辉大理岩，向下为金云蛇纹岩或金云白云石大理岩，与蛇纹岩成渐变关系。蛇纹岩原岩为菱镁矿大理岩和镁橄榄岩，蛇纹石化镁橄榄岩中以产出硼镁铁矿为主，蛇纹石化大理岩中主要产出硼镁石。矿石化学成分反映，B2O3品位变化与MgO含量正相关，高品位硼矿石MgO含量均在40％以