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文章以中国热带农业科学院为例,分析了其在推动农业科研机构体制机制改革的具体工作中所面临的问题,并针对问题提出建议,如农业科研机构科技创新资源布局优化问题建议通过内设机构设置调整、科技创新平台清理、内部管理方式改革来解决;激励机制改革难点则要通过解决改革目标与措施衔接问题、发展目标与团队目标错位问题等来攻克;而在改革方式选择问题上,指出农业科研机构个体内部适合自上而下方式,系统整体适合自上而下与自下而上相结合的方式等,以期对同类单位的体制机制改革有所借鉴。