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查干诺尔铜矿床产在西伯利亚板块和华北板块汇聚带附近，华力西晚期构造岩浆带内。成矿与早二叠世洋盆闭合，后碰撞高钾钙碱性花岗岩类岩浆演化晚期的钾质花岗岩有关。铜矿（化）体呈细脉浸染状产在钾质花岗岩的内外接触带内。铜矿石的主要金属矿物为黄铜矿、黄铁矿、闪锌矿、方铅矿等；化学组分以铜、钼、金、银、铅、锌为主。主要的矿化发生在热液期，围岩蚀变明显，有钾长石化、绢英岩化、高岭土化、青盘岩化等。铜矿形成在华力西晚期，属斑岩型铜矿床。