三门峡水利枢纽特殊的建设与管理经历导致三门峡水利枢纽工程边运行边改建,工程运行受泥沙、水库运用方式、设施和设备老化等因素影响大。针对三门峡水利枢纽的实际状况及特点,合理设置管理机构,以职定岗,以岗定人,编制和修订了完备的管理制度,进行工程巡检与监测,对设施、设备进行养护维修与更新改造,加强枢纽安全管理、坝区管理、通信及信息化管理、坝区旅游管理,枢纽管理单位经过几十年的管理实践,形成了一套适合三门峡水利枢纽行之有效的工程管理方法,初步实现了工程管理制度化、规范化、标准化,维持了工程设施的完整性和完好性,实现了枢纽安全运行,探索出了"蓄清排浑"的水库运用方式,改善了库区和坝区环境,坝区旅游业得到发展,坝区划界确权工作取得阶段性成果,工程管理工作取得了明显成效。今后,要进一步开展三门峡水库运用方式的研究;引进推广新技术、新装备、新工艺、新材料及先进管理方法,进一步解决制约工程管理的技术和管理问题;建设"数字枢纽",打造"智慧景区";探索工程管理新模式;持续提高工程管理水平,向建设国家一类水管单位的目标迈进。