应用PCR-直接测序法测定结核分支杆菌rpsL基因突变的研究

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目的:了解我国结核分支杆菌耐链霉素(Streptomycin,SM)分离株rpsL基因突变情况,建立快速检测结核分支杆菌耐药基因型的分子药敏试验方法。方法:通过聚合酶链反应(PolymeraseChainReaction,PCR)-单链构象多态性(Single-strandedConformationPolymorphism,SSCP)、PCR-限制性片段长度多态性(RestrictionFragmentLengthPolymorphism,RFLP)和PCR-直接测序法(DirectSequencing,DS)分析38株结核分支杆菌耐SM分离株的rpsL基因。结果38株耐SM分离株中,25株SSCP异常、不被MboⅡ消化、DS分析43位密码子AAG→AGG突变;1株SSCP异常、可被MboⅡ消化、DS分析33位密码子GTA→ATA突变;12株SSCP正常、可被MboⅡ消化、DS分析未见异常;未发现88位密码子突变。结论:大多数结核分支杆菌耐SM是由于其rpsL基因43位密码子突变所致,采用PCR-SSCP、PCR-RFLP和PCR-DS方法可快速测定部分结核分支杆菌SM耐药基因型。 OBJECTIVE: To investigate the mutation of rpsL gene in Streptomycin (SM) isolates of Mycobacterium tuberculosis in China and to establish a molecular susceptibility testing method for rapidly detecting the genotype of Mycobacterium tuberculosis. Methods: Polymerase chain reaction (PCR) - single strand polymorphism polymorphism (SSCP), restriction fragment length polymorphism (RFLP) and PCR - direct sequencing DS) was used to analyze the rpsL gene of 38 Mycobacterium tuberculosis isolates resistant to SM. Results Thirty-five strains of SM-resistant isolates were abnormal and were not digested by MboⅡ. DS analysis of the 43-codon AAG → AGG mutation; one SSCP-type abnormality was digested by MboⅡ. The 33-codon GTA → ATA mutation ; 12 SSCP normal, can be digested by Mbo Ⅱ, DS analysis showed no abnormalities; no 88 codon mutation was found. CONCLUSIONS: Most Mycobacterium tuberculosis resistance to SM is due to the mutation at codon 43 of rpsL gene. The resistance of some M. tuberculosis strains to SM can be rapidly determined by PCR-SSCP, PCR-RFLP and PCR-DS.
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