【摘 要】
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目的验证纳米孔测序技术在呼吸道病原体应急检测中的可行性。方法对某上呼吸道感染患者的咽拭子标本进行总核酸抽提并定量,接着进行cDNA的逆转录合成和测序文库构建,在便携式
【机 构】
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东部战区疾病预防控制中心疾病预防控制所,中国人民解放军疾病预防控制中心传染病控制中心
【基金项目】
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国家自然科学基金(31701158),国家科技重大专项(2018ZX10713003),军队后勤重大项目(AWS16J020),军队后勤科研项目(CLB19J027)
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目的验证纳米孔测序技术在呼吸道病原体应急检测中的可行性。方法对某上呼吸道感染患者的咽拭子标本进行总核酸抽提并定量,接着进行cDNA的逆转录合成和测序文库构建,在便携式三代测序仪MinION上进行测序,然后对测序数据进行病原分类学分析,最后使用实时荧光定量PCR验证测序结果。结果MinION在15 h内共计产生188063条有效序列。测序数据分析表明,在咽拭子样本中同时检测到人呼吸道腺病毒7型和甲型流感病毒H3N2亚型,分别有19和4条序列匹配到参考基因组。测序开始9 h内,MinION已分别产出78.95
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