【摘 要】
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为研究防腐剂抗性菌的基因组信息，了解其耐防腐剂机制，从研究院调味面制品中挑选防腐剂超标同时菌落总数超标样品中分离出一株大肠埃希氏菌FP20827，基因组测序，为以后快速检测提供相应的基因序列信息。本研究通过对FP20827菌株进行基因测序，并应用相关软件对测序数进行基因组拼接、基因元件预测、CRISPR预测、COG/GO功能分类注释、KEGG功能分类注释等。结果表明FP20827基因组大小为6923890bp，预测有6110个基因，GC含量为45.12。通过NR库比对注释，对应基因有6003个；通过COG
【机 构】
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食品安全监测与预警湖南省重点实验室·湖南省食品质量监督检验研究院，湖南长沙 410117;食品安全监测与预警湖南省重点实验室·湖南省食品质量监督检验研究院，湖南长沙 410117;食品安全监测与预警湖
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为研究防腐剂抗性菌的基因组信息，了解其耐防腐剂机制，从研究院调味面制品中挑选防腐剂超标同时菌落总数超标样品中分离出一株大肠埃希氏菌FP20827，基因组测序，为以后快速检测提供相应的基因序列信息。本研究通过对FP20827菌株进行基因测序，并应用相关软件对测序数进行基因组拼接、基因元件预测、CRISPR预测、COG/GO功能分类注释、KEGG功能分类注释等。结果表明FP20827基因组大小为6923890bp，预测有6110个基因，GC含量为45.12。通过NR库比对注释，对应基因有6003个；通过COG库对比注释，对应基因有4212个，按功能可分为14类；根据比对KEGG库，得到2346个基因，共参与14类代谢通路；通过GO库对比注释，对应基因有4070个，按基因功能可分为12类；通过CAZy库比对注释，得到241个基因，根据碳水化合物酶分为5类；通过VFDB库比对注释，对应毒力因子相关的基因378个，核心基因357个；共有耐药基因102个。
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