朱元璋定鼎南京后，将元顺帝赶到草原放羊去了，但此时天下大局未定，很多人还在观望，其中包括衍圣公孔克坚。
　　朱元璋派人向孔克坚传达了亲切的问候，请他南下面圣。孔克坚前半生备受元朝封赠，对元朝感情颇深，加上此时已年过半百，身体不够硬朗，怕经不起舟车劳顿，于是假托生病，先派儿子去南京觐见。
　　这副“骑墙”态度让朱元璋有些生气，写信追问：“听说你生病了，是真的吗？”还给孔克坚的儿子下了一道手谕，明确说：“尔若无疾称疾，以慢吾国，不可也。”孔克坚自然清楚“不可”二字背后的凶残，于是战战兢兢地撑起老骨头，来到朱元璋的面前。
　　一番寒暄后，朱元璋“平易近人”地說：“你身体不好，就负责督促子孙好好读书吧，不要辜负祖宗留下的好法度。”然后赐给他一匹马、一座宅子、20石米。孔克坚拜别后，朱元璋又对身边的臣子说：“你再嘱咐他一遍，让他多读书、少喝酒。孔子的后代养起来就好了，不用让他们做什么官。”曾在元朝官至国子监祭酒的孔克坚闲了两年就病死了。
　　1369年，朱元璋下诏，“只在曲阜拜拜孔子就好，不必举国祭祀。”这对天下读书人而言，无异于晴天霹雳。很多臣子上疏反对，但朱元璋一意孤行。过了一段时间，他觉得此举与自己常说的“治天下以仁为本”相矛盾，这才收回成命。
　　其实，朱元璋屡次挑战孔子及儒家的权威，说到底争的是治理天下的路线。历代读书人奉行“道统”，相信思想可以跨越阶层、指导国计民生;而以朱元璋为代表的独裁帝王推崇“治统”，认定权力才是镇压天下的不二法宝。
　　朱元璋在登基之初曾与刘伯温对谈，刘伯温说：“孔子一生并未正经做过官，《论语》不过是他与弟子坐而论道的记录，如果真像赵普所说‘半部《论语》打天下，半部《论语》治天下’，那岂不是所有熟读《论语》的人都能挑战皇权？”这话说到了朱元璋的心坎上，他当即附和道：“我曾试过在《论语》中找治国之方，可愣是没找到！”
　　与朱元璋类似，很多统治者都试图把衍圣公当吉祥物，也不是所有衍圣公都有硬骨头。1644年，崇祯惨死，清军入京，衍圣公孔胤植迅速将一封洋洋洒洒的表章送到多尔衮的案头，其中言语深情到肉麻，“率土归城，普天称庆……山河与日月交辉，国祚同乾坤并永……”此时南方还在永历帝手中，大清连半壁江山都没占全，但这番马屁显然让多尔衮和顺治母子相当受用。于是孔胤植被封为太子太傅，孔府圣裔仍享优渥特权。
　　孔胤植感激涕零，次年再上表章，说孔府全体男子已响应“剃发易服”的号召。清廷求之不得，将北京最繁华地段的一座豪宅赏给孔胤植。而此时各地民众为坚守孔子“身体发肤受之父母”的古训而拒绝剃发，血流成河。孔子第62世孙寝食难安，给多尔衮写信说：“贵国既得中华，当用中华冠服！”多尔衮怒道：“看在你家祖宗的面子上就不砍你的头了，革职为民，永不录用！”
　　后来袁世凯掌权，孔府连发两封“劝进电”，希望他“早日登极，以慰民望”;到张勋掌权时，孔子第76世孙又忙发电“敬贺大喜”;再后来日本备战侵华，在东京大盖孔庙，孔府人士全程参与，并于1937年鼓吹中日“同文同种”;1938年，曲阜沦陷后，孔府“奉祀官”孔令煜还设宴款待日军各级头目，笑着合影留念。孔子若泉下有知，该何等痛心。