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从目前技术创新的参与主体看，多个实体通过合作的形式完成创新已经成为一种潮流。通过对整个联合创新系统经济效益的评价，可以间接地测定其合作伙伴选择是否合理。建立了合作创新系统经济效益的评价指标体系，并运用ANP（网络分析法）方法对整个系统的经济效益进行评价。该方法可以克服评价因素之间的相关性．为合作创新伙伴选择提供了一种定量的判断依据。