B型DNA中鸟嘌呤-胞嘧啶碱基对内双质子转移反应

来源 :物理化学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：sendan

【摘要】

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采用ONIOM（M06—2X／6—31G★：PM3）方法研究了单个鸟嘌呤-胞嘧啶（GC）碱基对和含GC碱基对的四种排序的DNA三聚体（dATGCAT,dGCGCGC，dTAGCTA，dCGGCCG）的双质子转移反应．通过分析其双质子转移

【作者】

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林月霞王红艳高思敏吴颖曦李汝虎

【机构】

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西南交通大学物理科学与技术学院

【出处】

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物理化学学报

【发表日期】

：

2013年6期

【关键词】

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密度泛函理论 DNA三聚体质子转移静电相互作用质子亲和势 Density functional theory DNAtrimer Proton tra

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采用ONIOM（M06—2X／6—31G★：PM3）方法研究了单个鸟嘌呤-胞嘧啶（GC）碱基对和含GC碱基对的四种排序的DNA三聚体（dATGCAT,dGCGCGC，dTAGCTA，dCGGCCG）的双质子转移反应．通过分析其双质子转移方式、质子转移过程中各结构的能量和氢键变化，总结出环境因素对GC碱基对双质子转移机理的影响．气相中，dCGGCCG三聚体中发生分步双质子转移，其它四种模型中均发生协同双质子转移．分析发现质子转移方式受上下相邻碱基对的静电相互作用和质子接受位的质子亲和势影响，dATGCAT和

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