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根据蔷薇科树种S基因的保守序列设计引物，利用PCR技术对8个新疆扁桃品种S基因进行扩增，获得了10个大小不同的S基因片段。测序结果表明，这些DNA片段的核苷酸序列中都具有编码蔷薇科S-RNAase 5个高度保守区域：C1、C2、C3、RC4、C5的序列、编码高变区（RHV）的序列以及变异度很大的内含子序列，并且其高变区和内含子序列具有扁桃S基因特异性。同源性分析表明，获得的10个氨基酸序列与蔷薇科中李亚科S-RNase的氨基酸序列同源性达67％～96％，扁桃与樱桃、杏应同属于李亚科。