水稻逆转录转座子RIRE10拷贝数与LTR区转录活性的鉴定

来源 :生物化学与生物物理学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：guxingyiren

【摘要】

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在水稻第四号染色体的长臂上鉴定了一个结构完整的Ty3型逆转录转座子RIRE10。RIRE10两LTR间的中间区域在gag pol的上游还包含另一个开放阅读框。通过RT PCR与Northern印迹杂

【作者】

：

王嵘洪国藩韩斌

【机构】

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中国科学院上海生命科学研究院国家基因研究中心,中国科学院上海生命科学研究院国家基因研究中心,中国科学院上海生命科学研究院国家基因研究中心上海200233,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生

【出处】

：

生物化学与生物物理学报

【发表日期】

：

2003年08期

【关键词】

：

逆转录转座子 LTR RIRE10 栽培稻拷贝数中间区域同源重组印迹杂交结构域 DNA

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在水稻第四号染色体的长臂上鉴定了一个结构完整的Ty3型逆转录转座子RIRE10。RIRE10两LTR间的中间区域在gag pol的上游还包含另一个开放阅读框。通过RT PCR与Northern印迹杂交检测到来自LTR区的转录产物 ;根据点杂交结果 ,鉴定出包含中间区域的RIRE10成员的个数以及LTR区的拷贝数。除了 6 5个完整的逆转录转座子所具备的两个LTR外 ,水稻基因组还含有近 90 0个RIRE10的solo LTR。LTR区的转录以及导致solo LTR产生的同源重组可能影响了RIRE10成员在水稻基因组中的转座活性

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