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1998-2008年的10年间，台湾地区政府推行了农业生物技术“国家型”科技计划。该计划共执行了三期并于2008年结束，各期计划执行期限3-4年不等，其中第一、二期研究的重点是疫苗开发、经济作物培育及转基因技术，关注的是基础领域研究；第三期的重点放在推进植物、动物和转基因技术的成果转化和产业化推广。在计划的执行期内，各期投入经费逐渐增多，计划项目的专利和论文的产出比较丰富，但总体的成果转化率并不算高。