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考虑外部环境影响,运用三阶段DEA（数据包络分析）模型对我国30省2015年高校科研投入产出的相对有效性进行了评价。结果表明：三阶段DEA模型测度高校科研投入产出的有效性比传统DEA法更合理,外部环境因素对高校科研效率有着显著影响,各省应根据自身科研效率特点采取措施提高纯技术效率或扩大科研规模,以增强高校科研效率的内在动力。