稻瘟病菌基因组中微卫星序列的频率和分布

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利用已经公布的稻瘟病菌基因组测序结果,对该植物病原真菌基因组中的微卫星(SSR)的类型、大小及分布进行了系统分析.在已经公布的37.89 Mb的基因组序列中,共有16 398个由1~6个核苷酸为基序的SSR序列(匹配值为80%),其总长度占整个基因组碱基数的0.87%,平均2.31kb碱基中就分布有1个大于15 bp的SSR.其中数量最多的是单碱基重复,达到4 392个,其次为三碱基重复序列(3 586个),五碱基重复序列(3 442个),这3种SSR总数达11420个,占SSR的69.7%.数量最少的是
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