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研究生培养机制运行模式包括动力来源、培养模式和成本分担方式等。根据动力来源不同，运行模式分为行政管理模式、科研主导模式和需求导向模式。目前我国研究生教育的动力来源构成决定了研究生培养机制的运行仍以行政管理模式为主，由此导致了在招生机制、培养方式以及成本分担机制等方面问题的产生。对研究生培养机制运行模式的改革，应着力改变这种单一模式为主导的情况，形成多种运行模式均衡发展的、复合的培养机制运行模式格局。