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目的:建立连翘药材的超高效液相(UPLC)指纹图谱,结合主成分分析法评价秦巴山区连翘的质量.方法:采用UPLC法,流动相2 ml·L-1甲酸水-乙腈梯度洗脱,获得13批连翘药材指纹图谱,进行相似度评价,确定共有峰,以连翘苷为参照峰,采用SPSS19.0软件进行主成分分析.结果:13批连翘药材的UPLC指纹图谱有5个共有峰,相似度为0.732～0.944.经主成分分析,2个主成分因子的累计方差贡献率为87.674％,以S12(湖北十堰郧阳区)药材样品的主成分因子综合得分最高,整体质量最好.结论:秦巴山不同地区连翘存在一定质量差异,通过指纹图谱与主成分分析相结合,可为连翘药材的质量控制及开发应用提供参考依据.