【摘 要】
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目的 利用多种数据库分析SIRT5在泛癌中的表达及与预后的关系并探究SIRT5通过醛脱氢酶5家族成员A1（ALDH5A1）调控乳腺癌增殖的机制。方法 使用cBioPortal、TNMplot、GEPIA与The Kaplan-Meier Plotter等数据库分析SIRT5在多种肿瘤中的基因改变、差异表达及与预后的相关性。利用质谱分析与SIRT5相互作用的蛋白质。使用Metascape对相互作用蛋
【机 构】
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中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室
【基金项目】
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中国医学科学院基本科研业务费（2019-RC-HL-007）；
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目的 利用多种数据库分析SIRT5在泛癌中的表达及与预后的关系并探究SIRT5通过醛脱氢酶5家族成员A1（ALDH5A1）调控乳腺癌增殖的机制。方法 使用cBioPortal、TNMplot、GEPIA与The Kaplan-Meier Plotter等数据库分析SIRT5在多种肿瘤中的基因改变、差异表达及与预后的相关性。利用质谱分析与SIRT5相互作用的蛋白质。使用Metascape对相互作用蛋白质组进行通路富集，并与酰化组学结果进行共分析。通过内外源免疫沉淀（IP）确定SIRT5与ALDH5A1间的相互作用。过表达或敲降SIRT5检测ALDH5A1的酰化水平与酶活改变。通过细胞增殖与克隆实验确定SIRT5与ALDH5A1对乳腺癌增殖的影响。结果 SIRT5在乳腺癌等多种肿瘤中高表达并与不良预后成正相关（P＜0.05）。SIRT5相互作用蛋白与酰化组学结果存在多个重叠，并主要富集到氨基酸代谢等代谢通路上。SIRT5与ALDH5A1存在相互作用。SIRT5可通过促进ALDH5A1的去琥珀酰化从而提高其酶活，进而促进乳腺癌细胞增殖（P＜0.05）。结论 SIRT5在肿瘤中的功能可能具有异质性，在乳腺癌中可通过ALDH5A1发挥促癌作用，为后续的临床靶向治疗提供理论基础。
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目的 本研究基于生物信息学分析糖尿病肾脏疾病（diabetic kidney disease,DKD）患者与健康人群之间的基因芯片数据，筛选DKD上皮间充质转化的差异表达基因，从而探讨其相关发病机制，进而预测治疗DKD的潜在中药。方法 从基因表达数据库下载GSE23338芯片数据，采用R语言筛选相关差异表达基因，并对差异基因进行基因本体论、京都基因与基因组百科全书数据库分析，通过STRING网站构
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