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目前,肠道病原菌分子分型技术主要包括脉冲场凝胶电泳、多位点基因序列分析、多位点可变数量串联重复序列、扩增片段长度多态性分析、随机扩增多态性分析、基因芯片等,在肠道致病菌的鉴定溯源、流行病学调查、监测及疫情的预防控制等方面发挥了重要作用。本文着重对肠道病原菌分子分型研究方法的近况及其在流行病学中的应用进行了综述。