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虽然高山姬鼠在四川省主要农区并非优势鼠种,但却广泛分布于盆周山区,在川西南地区捕获率可达30%,优势度达90%,严重田块农作物危害率达80%,呈暴发危害,经设点监测发现该鼠年内数量变化呈单峰型,高峰期在10月,数量增加与繁殖力直接相关。高山姬鼠在不同群落中数量差异极大并和群落多样性有明显关系。